KMI Ehime terbentuk pada tahun 2025 dan telah terdaftar resmi di KBRI Tokyo sebagai bagian dari jaringan diaspora Indonesia di Jepang. Berbasis di Matsuyama, Ehime — wilayah di Pulau Shikoku yang sebelumnya belum memiliki wadah komunitas Muslim Indonesia yang terkoordinasi, tidak seperti kota-kota besar seperti Tokyo atau Osaka — kehadiran KMI Ehime menjawab kebutuhan warga Indonesia di sana untuk beribadah dan bersilaturahmi bersama.